Limitowana wersja, która nie ma nawet żadnej unikatowej nazwy – nazywa się Limited Edition - różni się jedynie wizualnie od standardowego modelu. Ma żółty lakier Bahama, dostępny tylko w tej wersji i czarne, biegnące górą wzdłuż nadwozia pasy. Ten sam motyw pojawił się w dolnej części linii bocznej wraz z oznaczeniem modelu. Ostatnim dodatkiem są czarne lusterka. Tak skonfigurowana Toyota GT86 odpowiada pod względem wyposażenia wersji Prestige.
Cena Toyoty GT86 Limited Edition to 139 900 zł, czyli o 3000 zł więcej niż najbogatsza odmiana Prestige. Różnica w cenie wynika ze standardowej w Toyotach dopłaty za lakier metaliczny.
